Робота закладів охорони здоров'я Балаклійського району направлена на поліпшення стану здоров'я усіх верств населення, зниження рівня захворюваності, продовження активного довголіття і тривалості життя, поліпшення демографічної ситуації, підвищення якості та ефективності медико-санітарної допомоги. Мережа лікувально-профілактичних закладів Балаклійського району являє собою систему взаємодіючих між собою закладів охорони здоров'я: 33 фельдшерсько-акушерських пункти, 7 амбулаторій загальної практики сімейної медицини, 1 дільнична лікарня в с. Петрівське та 3 міські лікарні: Андріївська, Червонодонецька, Савинська, стоматологічна поліклініка та центральна районна лікарня.
Балаклійська центральна районна лікарня має потужну амбулаторно-поліклінічну базу - відділення на 800 відвідувань за зміну, а також стаціонар на 365 ліжок цілодобового перебування, де є 10 стаціонарних відділень.
За останні роки в лікарні були впроваджені сучасні технології по діагностиці та лікуванню. Сучасна потужна технологічна база лікарні дозволяє проводити в широкому діапазоні діагностичні методи дослідження: ультразвукове, всі види нейро-фізіологічного обстеження та функціональної діагностики, рентгенологічне обстеження, електропунктурну діагностику, лікування по методу Фоля, а також імунологічні, серологічні, біохімічні дослідження та дослідження біологічного матеріалу.
Протягом 20 років лікарня являється базою для підготовки лікарів-інтернів. У лікарні працює 165 лікарів, з яких 50% вищої атестаційної категорії. Щорічно у стаціонарі лікуються 12 тис. хворих, швидка допомога обслуговує 18 тис. викликів, у пологовому відділенні народжується 700 дітей, в поліклінічному відділення жителями району робиться 430 тис. відвідувань. 94% населення району обслуговують лікарі сімейної медицини.
Мережа денних стаціонарів району в амбулаторне поліклінічних умовах складає 212 ліжок денного перебування. На 10 тис. населення припадає 23,5 ліжка денного перебування, на яких проліковано за 2004 рік 8401 чоловік.
У районі функціонує 53 дільниці загальної практики сімейної медицини. Обслуговуванням сімейних лікарів охоплено 93,9%чоловік.
Завдяки впровадженню сімейної медицини в охорону здоров'я району зменшилась кількість викликів швидкої допомоги по району. Щорічно зменшується питома вага виїздів швидкої допомоги до хронічних хворих, які обслуговуються сімейними лікарями ЗПСМ.
Захворюваність на туберкульоз в районі на 100 тис. населення склала 86,4 чол., у 2003 році - 96,3 чол., у 2002 році - 97,2 чол., що говорить про незначну тенденцію зниження захворюваності такою соціальне небезпечною хворобою як туберкульоз.